古埃及人会用刀切开下腹，取出肺、胃、肠和肝，需要做到不破坏皮肤，保持尸身在外观上的完整性。这些内脏需要保存好，古埃及人会用香料进行防腐处理，然后放在特制的陶罐中，这些罐子被称为卡诺匹斯之罐。卡诺匹斯之罐有4个，哈匹（狒狒头）守护肺，杜阿木特（豺头）守护胃，伊姆赛提（人形）守护肝，库波乃夫（鹰头）守护肠子。
这四个罐子也代表了四个方向。完成这些，到了第三步，就需要为尸体进行防腐处理。在用香料清洗干净处理过的尸体后，就需要往尸体内部填入没药、桂皮等香料，然后用浸过树脂的亚麻布将尸体包扎好。接着使用泡碱让尸体脱水。新王国时期的古埃及人已经学会将泡碱稀释成一种溶液，将尸体泡在这些溶液中，泡碱溶液会让尸体中的水分逐渐被抽走，泡碱进入软组织中，保证尸体不腐烂，而且这样处理过的尸体相当柔软，更显真实。
大约经过40-70天，会将泡碱中的尸体取出，转送至被称为“圣洁之所”的屋内，这时就是处理尸体的第四步了。这时需要用树脂浸泡过的亚麻布进一步将腹腔填充完整，然后缝合切开取内脏的口子，并用松树油、蜡、泡碱和树脂合成的物质涂抹尸体，最后再撒上香料。处理完这些后，还需要对尸体进行填充美容，让尸体与生前的样子更贴近。
例如有时要把鼻子加固，使其挺立，还要在眼窝中塞上东西或假眼球。填充完毕后，工匠还要给木乃伊染色，男的染红色，女的染黄色，最后再用亚麻布将尸体层层包裹，使其与生前外形相似，再放入人形馆中。这是最完整，也是最贵的制作木乃伊的方法，一般都是达官贵人或有钱人才能采用。希罗多德介绍到，一般普通人，没有太多的钱，会采用第二种制作方案，这种比较便宜。
方法是这样的：工匠既不切开尸体，也不取出内脏，而是将杉树提取出的油通过注射器由肛门注射到腹部中，注射完后，就将肛门堵上以防油脂流出，接着将尸体埋在泡碱中，过了一些日子，再将尸体取出来。这时身体内的杉树油已经溶解了体内的内脏，工匠会让杉树油流出体内，尸体就只剩下皮和骨。制作木乃伊的方法还有第三种方案，这是给那些穷人使用的，方法更加简单粗暴。
工匠基本不对尸体进行过多加工，只是用泻剂将尸体的腹部清洗一下，然后将尸体放到泡碱中浸泡70天，再取出来交给尸体的亲属。参考文献：令狐若明：《揭秘木乃伊制作》，《大众考古》希罗多德：《历史》中青：《科学家利用现代人遗体复原法老木乃伊制作过程》金寿福：《征服死亡的尝试——论古代埃及人制作木乃伊的动机和目的》王宁：《新王国时期埃及皇家丧葬文化的人类学诠释》，河北师范大学。
